12-) TSK içerisindeki bazı subaylar tehdit ve şantajla bu örgüte boyun eğip kontrole girdiğinden etkisiz hale getirilmiş, örgüt karşısında herhangi bir varlıkları kalmadığından susturulmuştur. Örgüte karşı olan bir kısım subaylar ise sempatik ilişkiler veya gelecek kaygıları ile hareketsiz bırakılıp örgüte karşı çıkamaz hale getirilmiştir.
Örgütle ilişkisi olmayan bir kısım TSK mensupları ise sivildeki işleri halledilip makam ve para kullanılarak menfaat karşılığı örgüte boyun eğmek zorunda bırakılmıştır.
13-) FETÖ mensubu olmayan veya bu örgüte boyun eğmeyen TSK'daki birçok subayın verilen notlar ile sicillerinin bozulmuş, terfileri engellenmiştir. Bu yöntemlerle etkisizleştirilmişlerdir. Sicilleri bozulan subaylar gelecek beklentileri kalmadığından ya ayrılmak veya emekli olmak zorunda bırakılmıştır.
14-) TSK, dini görüşlerini ılımlı bulduğu bu gruba 12 Eylül 1980 sonrasında müsamaha ve müsadekar bir gözle bakmıştır.
Askeri makamlar irtica ile mücadele adına diğer dini cemaat mensuplarına karşı acımasız bir şekilde tolerans tanımazken FETÖ üyelerinin tedbir uygulaması ve gizlenmelerinin de etkisi ile TSK içerisinde kadrolaşmalarına engel olamamışlardır.
Fetullah Gülen ve örgütü, TSK'da birebir mensuplarıyla ilgilenmektedir ve yalnızca burada her bir hücre genellikle tek kişiden oluşmaktadır.