Ama aslında sorunlar yeni başlıyordu. Melikşah’ın kardeşi Suriye Selçuklu Sultanı Tutuş, yeğenine karşı isyan etti. Yapılan savaşı Berkyaruk kaybedince İsfahan’a kaçtı. Burada bulunan kardeşi Mahmud’un (Daha önce Berkyaruk burda, Mahmud Bağdat’taydı. Şimdi yerler değişmişti.) adamlarında Emir Üner, ayaklarına kadar gelen fırsatı kaçırmak istemedi ve Berkyaruk’u tutukladı. Ardından bir daha sultanlık iddiasında bulunmaması için gözüne mil çekmeye karar verdi. Fakat kader ağlarını örmüştü.:) Bu sırada Mahmud suçiçeği oldu ve bir hafta sonra da vefat etti. Onun vefat etmesi ile Berkyaruk kurtuldu ama Terken sultanı da artık etrafındakiler terk ettiler. Çünkü elinde oynayacağı başka bir oyuncak kalmamıştı. İşin ilginç yanı Mahmud’dan sonra Berkyaruk’da çiçek hastalığına tutuldu. Bunlar zaten çocuktu, fakat o hastalığı atlattı. Artık, Berkyaruk’un gücü arttı ve kendisine katılan yeni emirlerle amcası Tutuş’u (Anadolu Selçuklu Sultanı Süleyman Şah’ı öldürmesini sağlayan kişidir.) yenip öldürdü ve kendisine karşı Horasan’da isyan eden diğer amcası Arslan Argun’u da öldürdü. Bundan sonra Berkyaruk’un dönemi başlayacak.
Kardeşi Sencar’ı Horasan Sultanı yapan Berkyaruk’un karşısına bu sefer diğer kardeşi Muhammed Tapar çıktı. Muhammed Tapar’ı harekete geçiren Nizamulmulk’ün oğlu Müeyyidülmülk’tü. Çünkü onu vezirlikten azletmiş o da Muhmmed Tapar’ın safına geçmişti. Müeyyidülmülk, çok nüfuzlu ve güçlü bir şahıstı. Bu arada Anuştekin bağımsızlığını ilan ederek Harzemşahlar devletini kurdu.
Müeyyidülmülk, Abbasi halifesi ü...